ceRNA分析

ceRNA分析

利用miRNA芯片数据,lncRNA芯片数据,结合miRNA靶基因预测软件,寻找mRNA与lncRNA共同靶向的miRNA,构建ceRNA网络。

前置分析条件

  • 客户需要提供miRNA芯片数据,lncRNA芯片数据,mRNA芯片数据;
  • 样本量不能少于6个;
  • 限定物种为:人,小鼠,大鼠

分析结果

01.miRNA_target
02.corelation
03.miRNA_target-filtered
04.ceRNA_score
05.ceRNA_score-filtered
06.ceRNA_network
07.annotation

Demo数据

Demo结果解读

图中展示了mRNA与lncRNA共同调控的miRNA,两点间线条的多少代表miRNA与mRNA/lncRNA关系的来源。