DNA甲基化检测服务

DNA甲基化是最早发现的基因表观修饰方式之一,真核生物中的甲基化仅发生于胞嘧啶,即在DNA甲基化转移酶(DNMTs)的作用下使CpG二核苷酸5’-端的胞嘧啶转变为5’-甲基胞嘧啶。DNA甲基化通常抑制基因表达,去甲基化则诱导了基因的重新活化和表达。这种DNA修饰方在不改变基因序列前提下实现对基因表达的调控。

亚硫酸氢盐处理的Sanger测序痕量甲基化检测

CpG二核苷酸的胞嘧啶位置的DNA甲基化与基因调控密切相关,包括基因组印记,差异基因表达和人类疾病。DNA的亚硫酸氢盐处理然后测序是研究DNA甲基化的一种方法,其将未甲基化的胞嘧啶位置转化为尿嘧啶,使甲基化位置不受影响。在PCR扩增和核苷酸测序后,未被甲基化的胞嘧啶位置将被胸腺嘧啶取代,并且甲基化位置将保持为胞嘧啶。虽然许多软件包难以在亚硫酸氢盐处理的DNA中对齐和检测甲基化,但是在南博屹生物中通过独特的甲基化应用简化了该过程。用户只需加载GenBank参考文件,软件就会自动将胞嘧啶位置转换为参考中的胸腺嘧啶。南博屹生物快速准确地将亚硫酸氢盐处理的样品与经过修改的参考痕迹追踪对齐,通过其专利痕迹自动检测甲基化位置,以追踪反相关技术。

甲基化痕迹的比对和检测

甲基化痕迹的对比和检测

南博屹生物能够通过修改参考文件的核苷酸序列,准确地检测亚硫酸氢盐处理的样品序列中的甲基化。选择甲基化选项后,南博屹生物会将参考文件中的胞嘧啶位置转换为胸腺嘧啶。然后通过南博屹生物检测样品痕量中的甲基化胞嘧啶位置。

甲基化报告提供胞嘧啶位置的甲基化状态

甲基化报告提供胞嘧啶位置的甲基化状态

南博屹生物的甲基化报告自动确定样品痕迹中胞嘧啶核苷酸的甲基化状态。CpG岛内的胞嘧啶位置标记为甲基化(M)或未甲基化(U)。CpG岛外的胞嘧啶位置被标记为不完全(I)转化为胸腺嘧啶或成功(S)转化为胸腺嘧啶。

甲基化图形显示报告突出甲基化模式

甲基化图形显示报告突出甲基化模式

甲基化应用的图形显示报告提供了样本文件与GenBank参考对齐的图形表示,以及突变项目中所有样本的甲基化模式的表示。红色刻度线代表CpG岛内的甲基化胞嘧啶,浅蓝色刻度线代表CpG岛外的甲基化胞嘧啶。

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