文献解读丨不做实验,蛋白组纯生信照样发SCI

今天分享的一篇发表在《Andrology》的文章。文章作者是南方医科大学附属第三医院的泌尿系医生,他们主要通过蛋白质组学分析方法从人精浆里发现了外泌体,有助于日后进一步筛选出治疗雄性不育和前列腺癌的生物标志分子。

IF=2.863区期刊

文章大致思路

简单介绍一下文章的研究结果
为了鉴定外泌体的存在,作者首先用western blot鉴定了外泌体标记蛋白HSP70CD81TEM结果显示,精浆外泌体有一层脂质双层膜。这些数据可证明外泌体成功地从精浆分离和纯化出来。

随后,作者用LC-MS/MS蛋白质组学分析了精浆外泌体蛋白成分。作者在两组中鉴定出1474个蛋白。当中有24%是重叠蛋白,包括ALIXHSP70ACTBGAPDHPHGDHLGALS3PSEMG1。然后作者又通过生信方法对非重叠蛋白做富集分析,分析其细胞成分。结果发现。大部分蛋白与外泌体、溶酶体和胞浆有关,表明这些非重叠蛋白很可能源自于精浆外泌体。然后GO分析了这些外泌体的功能,都跟代谢、细胞生长与修复、转运有关。

看了一遍大致上流程是不是觉得自己可以做了呢。概括而言,作者用了LC-MS/MS蛋白质组学分析了精浆蛋白后也就只用了简单的GOKEGG方法做了富集分析。分析方法简单,操作起来也简单,所以就能轻松发表在2-3分期刊了。

如果有朋友还对生信工具不太熟悉,跟着我们一起学习吧~

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